在练功的初期，由于思绪不容易立即集中，我们可能不能立即守住丹田。这时可以先采用逐步放松的方法，让思绪逐渐集中，杂念逐步减少，从而达到气沉丹田的静态状态。需要明确的是，意守的一个目的就是为了预防和排除杂念。在运用过程中，不要过分用力，而是应该像守护又不守护，既有也无。如果勉强死守，反而会引起不必要的紧张。因此，要注意意守时注意力的强度。意守时的注意力过小，杂念难以排除，丹田难以守住；意守时的注意力过大，虽然杂念可以减少，但可能导致头痛、头胀和精神紧张等不适症状的出现。所以，在练功初期，意守的火候应该稍微强一些，精神要放松，以不引起头胀头痛为宜。这样有助于排除杂念，帮助我们进入静态状态。随着练功实践的深入，可以逐渐降低意守的强度，达到守与不守之间的绵绵若存。
古代练功先贤们认为，通过一段时间的意守丹田锻炼，内气（此指感觉）会在该区域聚集，并逐渐产生一些热、重、胀以及类似热气流的感觉，逐渐明显起来。进一步锻炼，无需用意念引导，内气就可能自然地沿着任脉和督脉循行。
对于部分女性患者来说，如果在经期意守丹田时出现经期延长或经血过多的情况，可以改为意守中丹田，也就是膻中穴的位置。膻中穴位于胸部两乳之间，是中气汇集的关键之处，也是任脉与脾、肾、心包等经络汇集的地方。意守膻中穴，具有调和气血的作用，可以调节和治疗某些妇科疾病。
有些练功者在意守丹田时会出现呼吸紊乱，导致胸闷、气短；还有些人会感到小腹胀满不适或疼痛。这种情况下，应根据具体情况放弃意守丹田，改而守护其他部位或外景。