慢性结肠炎是一种长期的结肠炎症，常见症状包括腹痛、腹泻、便秘、腹胀等。中医认为慢性结肠炎主要是脾胃虚弱、湿热内蕴等引起的病理变化。
中医治疗慢性结肠炎一般采用调理脾胃、清热解毒的方法。常用的药物包括黄连、苦参、黄芩等具有清热解毒功效的中药。这些药物能够清热凉血、燥湿除热，有助于改善结肠炎的症状。
黄连是一味常用的中药，具有清热燥湿、解毒的作用，对于慢性结肠炎伴有腹泻、腹痛等症状的患者效果较好。可以单独使用或者与其他药物配伍使用。
苦参是另一种常用的中药，具有清热解毒、凉血止血的作用，对于慢性结肠炎伴有便血等症状的患者效果显著。
黄芩是一味泻火清热的中药，对于慢性结肠炎伴有腹胀、便秘等症状的患者有一定的缓解作用。
除了中药治疗，慢性结肠炎患者还应注意饮食调理和生活习惯。避免食用辛辣刺激性食物、生冷油腻食物，保持规律的作息时间，适当运动，有助于改善病情。
在使用中药治疗慢性结肠炎时，应根据个体情况选用合适的药物剂量和治疗方案。同时，注意药物可能的不良反应和禁忌症，避免造成不必要的副作用。
综上所述，针对慢性结肠炎的药物治疗效果最好的药物包括黄连、苦参、黄芩等具有清热解毒功效的中药。但在使用过程中，应结合个体情况选用合适的药物，并注意饮食调理和生活习惯的调整。如有不适或疑问，应及时咨询医生。